Doom sur Jaguar est un jeu de tir à la première personne. La planète Mars est envahie par des créatures de l'enfer à la suite de plusieurs expériences scientifiques. Vous incarnez un Space Marine qui a été condamné à des travaux forcés sur la planète rouge. Se retrouvant seul dans la base humaine, il tente de survivre en éliminant tous les monstres autour de lui.