Vous jouez maintenant avec Samanosuke. Avancez, afin de récupérer le bracelet par terre. Continuez tout droit, et ouvrez le coffre dans la deuxième cage de droite. Montez les escaliers. Une fois en haut, tuez les genmas, et sortez à l'extérieur. Tuez les ennemis, et descendez jusqu'au bateau. Prenez-le, et démarrez le moteur. Vous vous retrouvez au côté Est du zoo. Maintenant revenez dans la pièce où vous aviez vu une porte fermée par un sceau magique avec Michelle. En fait, allez à gauche, et montez les marches, en faisant attention. De l'autre côté, deux gorilles vous attendent. Tuez-les et continuez tout droit. Ouvrez la porte à côté de la caisse rouge, non sans avoir pris l'EcoE dans la poubelle près d'ici. Une fois à l'intérieur, réglez leur compte aux deux chevaliers et ouvrez la porte scellée grâce à la Kûga de niveau 2. Vous arrivez dans un débarras. Prenez l'objet sur l'armoire de gauche. Ce sont les clés du labo. Revenez maintenant au centre de recherche, en prenant le bateau. Faites toujours Attention sur le chemin aux gorilles, qui s'ils vous plaquent au sol, ne vous laisseront que peu de chance de survie. De même, un ogre vous attendra dans le navire. Utilisez la magie. Entrez dans le centre. La porte à passer n'est pas dure à trouver, c'est la seule gardée par un colosse. Attendez qu'il frappe le sol pour passer dans son dos et l'enchaîner. Sinon, vous vous heurterez à sa défense. Essayez sinon de feinter afin de le contourner. Utilisez la clé sur la porte maintenant. Des genmas vont sortir des sortes de cuves dans le couloir. Éliminez-les tous, en vous méfiant de leur roulade. Ils sont nombreux, attention. Puis, prenez la première à gauche. Écrasez les limaces, en évitant leurs sauts. Saisissez-vous du carnet dans le coin en haut à gauche de la salle. Prenez également le livre vert sur le bureau, puis le coffre bleu. Hop un pendentif Oni, et surtout une serrure un peu ardue. Ressortez de la salle, et continuez vers le point de sauvegarde, tout droit. Ouvrez la porte.

Vous allez enfin pouvoir vous débarrasser une fois pour toutes de ce fourbe de Guildenstern qui vous traumatise depuis le premier épisode. Mais le combat n'est pour le coup pas une partie de plaisir, loin de là. En effet, le savant n'est pas seul. Il réveille deux guerriers l'un après l'autre pour lui prêter main-forte. Le principe est le suivant. Vous ne pouvez toucher ce boss, que lorsque une lueur rouge apparaît dans son corps fantomatique. Attendez bien de l'apercevoir pour lui asséner un coup d'épée. Pensez bien à éliminer chaque soldat qu'il réveille avant de vous occuper de lui. Néanmoins il remettra à la vie ses serviteurs dès que vous commencerez à l'endommager. Au bout d'un moment il change de technique, et devient plus agressif. Équipé d'une sorte de lance énergétique, il ne se prive pas de vous la lancer à intervalles réguliers. Évitez cette dernière ou protégez-vous. Mais le problème vient du fait qu'il ressuscite désormais les deux guerriers simultanément. Vous obligeant à combattre trois personnes à la fois. Essayez d'échapper aux deux violents, et courez asséner un coup à Guildenstern, en vous méfiant des boules de feu de ces derniers. Tentez de les exterminer afin de vous laisser quelques secondes de répit, mais ne vous laissez jamais acculer contre une paroi. Continuez en frappant le boss dès qu'une occasion se présente, et en vous protégeant le plus souvent possible, même si la durée du combat s'étend un tantinet. N'hésitez pas sur la fin à recourir à votre forme de guerrier Oni. Une fois ce monstre anéanti, rendez-vous au Mont St-Michel. Après une séquence émotion mettant en scène la mère de Henri, vous prenez le contrôle de Samanosuke. Avancez alors dans la rue principale, sauvegardez, et ramassez le livre à terre de couleur jaune. Continuez tout droit, et brisez les deux poubelles. L'une d'elles vous donnera un EcoE. Battez les ennemis, puis revenez passer le relais à Jacques grâce au miroir violet.