Une fois l'histoire principale achevée vous pourrez accéder au niveau bonus qui vous permettra de récolter 1 000 000 de pièces Lego. Pour trouver la porte d'entrée, suivez les pièces guides à la fin de l'aventure (depuis Minas Tirith), ou dirigez-vous directement à la sortie de Fondcombe. L'entrée se trouve sous la cascade.
Le but du jeu est de tout détruire, vous pourrez utiliser tous les personnages que vous avez débloqués au cours du mode histoire et ceux que vous aurez éventuellement achetés. Le personnage de Shagrat (débloqué dans le mode histoire) sera suffisant pour détruire les éléments les plus solides comme les poignées orange. Vous pourrez débloquer deux personnages supplémentaires à l'issue du niveau Bonus (Sauron et " Sauron Bouche ").