Lorsque la trame principale sera terminée, le mode " Ligue des Justiciers " sera débloqué. Il permet d'incarner plusieurs héros en affrontant une vague d'ennemi. Pour y accéder, partez sur la gauche une fois dans la Batcave, puis remontez sur le haut. Activez un panneau sur la plateforme pour faire surgir le Batcoptère pour pouvoir lancer les missions.

Chaque mission vous permet également de débloquer un personnage si vous réussissez à obtenir le Rang Or.