L'infiltration tient une part primordiale dans l'univers de Metal Gear Solid. MGS4 ne déroge pas à la règle et oblige le joueur à agir le plus discrètement possible. Un système de rang récompensera même les meilleurs espions en fin de partie. S'il est possible d'adopter une attitude offensive et de parcourir grossièrement les zones du jeu sans trop se soucier du fait d'être repéré ou non, il demeure préférable d'adopter une attitude discrète et d'éviter autant que possible d'abattre qui que ce soit. Rien ne remplacera l'expérience et la pratique et vous apprendrez très probablement à manier les diverses techniques d'infiltration directement sur le terrain en apprenant la plupart du temps de vos erreurs. Soyez donc patient et sachez retenir les leçons.
L'OctoCamo
L'OctoCamo est une tenue de camouflage avancée, inspirée des habilités mimétiques de la pieuvre. Si son utilisateur reste allongé ou collé à un mur sans bouger, la tenue imite la couleur et la texture des surfaces, ce qui permet d'échapper à l'oeil nu et aussi aux infrarouges. C'est grâce à cet objet qu'il vous sera possible de traverser la plupart des zones de jeu sans vous faire remarquer.
Indice de camouflage
L'indice de camouflage apparaît dans le coin haut droit de votre écran. Il indique le degré de discrétion dont Snake bénéficie grâce à l'OctoCamo. Cette mesure change constamment suivant la texture du sol arpentée. Pour permettre à votre système de camouflage de s'adapter à une certaine texture, marquez simplement un temps d'arrêt. La mesure devrait alors se stabiliser autour des 75%. Veillez bien à toujours garder un minimum de 65% pour ne pas être repéré par l'ennemi.
Marcher debout
D'une manière générale, évitez absolument ce mode de déplacement très peu discret, source de nombreux ennuis en cours de mission. Préférez toutefois cette manière de progresser lorsque vous êtes repéré par l'ennemi et qu'il vous faut quitter rapidement une zone.
Progresser Accroupi
Le position accroupie permet de vous déplacer assez rapidement lors d'une zone à découvert, tout en conservant un certain degré de discrétion. Utilisez ce mode de déplacement pour surprendre un ennemi ou bien pour progresser de manière rapide dans des zones peu fournies en ennemis.
Ramper
C'est en rampant que l'OctoCamo pourra être le mieux exploité. Restez discret et un ennemi de base ne vous remarquera pas, même en passant à quelques centimètres de vous. En progressant à même le sol, vous atteindrez des textures différentes. Marquez donc un temps d'arrêt pour permettre à l'OctoCamo de s'adapter. Vous remarquerez alors que votre indice de camouflage (situé dans le coin haut droit de votre écran) n'en sera que meilleur. Théoriquement, ce mode de déplacement sera celui le plus utilisé au cours de vos sessions de jeu. Evitez toutefois de vous mouvoir trop rapidement quand Snake demeure dans le champ de vision d'un ennemi. En pressant plus ou moins fort le stick directionnel, différents niveaux de vitesse sont possibles.