Vous arrivez enfin face à Black Mask qui vous affronte. Pendant la première partie du combat, vous devez vaincre une dizaine de ses sbires pendant qu'il vous jette des grenades et vous tire dessus. Evitez en priorité les grenades en roulant sur la droite et sur la gauche. Le boss s'enfuit alors, vous laissant en compagnie d'un champ électrique. Examinez les lieux pour mettre en évidence les machines au fond de l'écran et passez par le sous-sol pour les désactiver. Après avoir fait le tour de la salle, vous comprenez qu'il faut désactiver les trois champs de force en même temps. Vous passez donc dans la salle suivante. Là, envoyez un batarang sur la sonnette tout à droite, cassez la lampe de gauche et passez sous le plancher. Une fois arrivé à droite, faites sonner l'alarme de gauche et dépêchez-vous de vous glisser sous la trappe du centre pour neutraliser d'un seul coup Black Mask durant son inspection. Le combat s'achève ainsi. Dirigez-vous maintenant vers l'aile d'administration pour vaincre le Joker.

Vous obtenez le trophée argent : Disjoncteur

Vous obtenez le trophée bronze : Fini la mascarade

Progressez vers la droite et passez la zone de gaz toxique avec la tyrolienne. Vous arrivez dans un bureau contenant un gros cadeau du Joker. Explosez les quatre interrupteurs avec du gel collant pour dévoiler une trappe. Dans le souterrain, n'oubliez pas la petite caisse d'amélioration en hauteur. Poursuivez et tombez dans la salle où les murs sont recouverts de peinture. Là, cassez le mur de droite et récupérez la clef de cryptage bêta sur le corps du gardien décédé. Vous pouvez ainsi poursuivre sur la gauche. Après une petite entrevue avec le directeur de la prison, vous apprenez qu'il faut passer par les toits. Retournez donc à l'entrée de la zone et poursuivez votre route en débloquant la porte bêta. Vous affrontez alors Deadshot et son sniper. La caméra est affichée depuis son viseur et vous devez avancer en vous cachant derrière le décor. Vous pouvez également lancer des batarangs sur les projecteurs lumineux afin de l'aveugler un instant. Vous entrez ensuite dans un petit bâtiment et achevez Deadshot avec la tyrolienne pendant qu'il est ébloui.

Vous obtenez le trophée bronze : L'homme qui ratait parfois sa cible