Allez donc parler à Knuckles comme vous le demande Tails, puis discutez avec ce dernier pour procéder à la suite des évènements. Vous allez devoir former deux équipes de quatre personnages, puis suite à ceci, c'est avec l'équipe de Sonic que vous débuterez votre avancée. Allez donc sur la gauche pour récupérer un oeuf, avant de remonter les escaliers pour vous retrouver à l'extérieur. Vous passerez alors à l'équipe de Tails. Empruntez cette fois la porte de droite, puis dans cette nouvelle pièce, récupérez le contenu du coffre, qui détenait notamment des gants en gomme. Avancez jusqu'au bout de la salle pour trouver le défragulateur à ions, qui s'ajoutera à votre inventaire en tant que " pièce d'arme ".
Vous repasserez alors à l'équipe de Sonic, puis vous aurez à rejoindre l'étoile indiquée au nord de la carte, tout en furetant quelque peu les environs pour quelques items (après avoir grimpé le mur de gauche avec Knuckles), au risque de vous frotter à certains gros robots qui patrouillent. Une fois l'étoile rejointe à l'aide Knuckles et après avoir sauté dans le hangar, nous repasserons à Tails et son équipe. Descendez plus bas dans cette pièce pour affronter deux gros robots, puis ouvrez le coffre de gauche pour récupérer son contenu. Suite à ceci, montez les escaliers de droite pour vous retrouver à l'extérieur.
Vous trouverez un coffre contenant des griffes émoussées sur le toit du bâtiment d'où vous sortez (en volant par la gauche). Revenez face à la porte de sortie et avancez jusqu'au pilier d'en face entouré par des rings, puis parlez au vieil homme pour accepter son énigme. Il s'agira de placer chacun de vos personnages devant un des panneaux de contrôle éparpillés dans le secteur. L'un doit se trouver devant le panneau de commande principal situé au sol, puis les trois autres devront se placer sur les panneaux dont la base sera jaune, rouge et bleu (le bleu est situé à l'opposé du panneau principal, de l'autre côté de la structure). Une fois tout le monde en place, actionnez le panneau principal pour faire apparaître une série de lumières. Reproduisez alors la séquence en sélectionnant les personnages adéquats et en leur faisant actionner leur panneau, puis après avoir réussi la manipulation à trois reprises, l'échelle s'élèvera et vous aurez rempli cette mission. Montez cet escalator, puis vous pourrez choisir ensuite de vous rendre à différents endroits de la carte, grâce au vol de Tails et aux ventilateurs. Tout en vous baladant où vous le pouvez et en affrontant ou esquivant les nombreux robots, récupérez quelques rings et autres oeufs, mais allez surtout récupérer la pièce d'arme dans le coffre situé au nord et représenté par une étoile.
Suite à cela, vous pourrez remplir une mission en pénétrant dans le bâtiment situé à gauche de la carte, accessible par des escaliers. Vous devrez sauver le robot Oméga en éliminant des drones. Vous le retrouverez un peu plus tard... Enfin, il s'agira de rejoindre la dernière étoile affichée au centre de la carte (en passant par le bas de celle-ci et en revenant sur le sol de droite), pour trouver l'ancien labo d'Eggman et passer à l'équipe de Sonic. Dirigez-vous en haut à droite pour aller battre le capitaine, puis vous reviendrez ensuite sur le groupe de Tails, après vous être approché des maraudeurs. Dirigez-vous au bas et à droite du chemin pour emprunter les escaliers et vous retrouver sous terre, à l'endroit du début de chapitre. Rejoignez la porte au bout du chemin le plus à droite, puis sortez par la porte de droite dans cette nouvelle pièce. Vous revoici au nord de la carte. Allez donc emprunter à nouveau l'escalator, puis volez vers la tour de gauche. Sautez une fois, puis utilisez l'icône de vol le plus à droite pour bientôt rejoindre le canon situé en haut des escaliers et affronter un soldat gardien de 210 PV accompagné de deux drones. Après les avoir vaincus, vous vous retrouverez bientôt à diriger l'équipe de Sonic.
Vous voici à Angle Island. Explorez les environs un maximum, histoire de faire le plein de rings et d'oeufs comme vous en avez l'habitude (équipez le Chao Fess si vous l'avez en votre possession, afin d'avoir plus de chance d'obtenir des Chaos rares), puis rejoignez la seule rampe existante, à traverser avec Sonic et située quasiment au centre de la carte (grâce à un tremplin). Vous ne pourrez ensuite plus faire marche arrière et devrez être prêt à affronter plusieurs ennemis à la suite. Veillez donc à optimiser votre équipement au maximum, puis montez les escaliers. Suite à votre premier duel, vous reprendrez le contrôle de l'équipe de Tails et aurez à revenir à l'atelier dans lequel vous vous trouviez au tout début du chapitre (après avoir descendu les escaliers situés en bas à droite de la carte, empruntez la porte la plus à gauche).
{{uppage}}Suite à la séquence, vous reprendrez le contrôle de Sonic et un deuxième combat débutera. Après l'avoir remporté, Tails vous rejoindra et vous pourrez réorganiser l'équipe pour entamer le combat contre Ix. Notez qu'Oméga a maintenant rejoint le groupe.
Boss : Empereur Ix
Utilisez les personnages disposant des attaques spéciales les plus puissantes, puis concentrez-les toutes sur Ix, jusqu'à vider vos PP dès le premier tour. Ix ne devrait pas en réchapper et il vous restera simplement à vaincre ses deux sbires avec ce qu'il vous reste de PP ou bien vos attaques normales. Prenez garde toutefois aux attaques spéciales de Ix, car il faudra faire preuve de réflexes et de sang-froid si vous souhaitez les contrer, étant donné leur rapidité. Une séquence se déclenchera, marquant la fin du chapitre.