Château de Bowser
Après la scène cinématique, parlez avec les personnages qui se trouvent dans le hall, entrez dans les pièces à l'Est et à l'Ouest et discutez avec tout le monde. Après quelques discussions, la porte qui se trouve au nord du hall principale s'ouvre.
Entrez par cette porte, sauvegardez et avancez au nord. Détruisez les deux cubes qui se trouvent dans les petites ruelles à gauche, à droite, poursuivez au nord et entrez dans le théâtre.
Avancez en avant de la scène pour déclencher une courte scène. Ensuite, revenez à l'entrée, regardez une autre scène et préparez-vous à affronter Métaboss.
Boss : Métaboss
Ce boss possède trois types d'attaques différentes. Dans la première attaque, il utilise une boule de fer et tourne autour de lui en s'approchant de Bowser. Réfugiez-vous dans la carapace et attendez qu'il parte. A la fin de l'attaque, il jette la boule de deux façons. Soit directement en face de Bowser ou au-dessus de celui-ci. Dans le premier cas, utilisez le coup de poing pour contrer et dans le second cas ayez recours à la carapace.
Lorsque les spectateurs lui donnent à manger, utilisez l'Aspirobloc et aspirez le tout. Ensuite, attaquez-le avec un coup de poing bien placé et préparez-vous à contre-attaquer.
Dans la seconde attaque, il se gonfle, s'approche de vous et frappe. Lorsqu'il s'approche, appuyez rapidement sur les coups de poing pour le contrer. Dans l'attaque suivante, il commence à rebondir sur le sol puis retombe sur Bowser de deux manières. S'il tombe devant Bowser, utilisez le coup de poing pour le contrer. S'il tombe sur Bowser, utilisez la carapace pour contrer.
Utilisez toujours les coups de poing pour l'attaquer, empêchez-le de manger la nourriture que les spectateurs lui donnent et battez-le.
Après le combat, une scène se déclenche et vous rejoignez une grande salle remplie de nourriture. Mangez toute la nourriture pour qu'une scène se déclenche puis reprenez le contrôle de Mario et Luigi.
Zone adipeuse
Avancez à droite, sautez sur les plates-formes et allez à gauche. Détruisez le bloc, revenez à droite et sauvegardez la partie.
Poursuivez à droite, détruisez le bloc A et sautez sur la couche de graisse. Détruisez deux blocs, poursuivez à droite et rejoignez la prochaine zone.
Après la scène, sautez pardessus les plates-formes et atteignez la prochaine zone. Une autre scène se déclenche suivie d'un tutoriel. Effectuez ce tutoriel et apprenez comment utiliser les badges. Par la suite, sautez sur les plates-formes à gauche et partez à droite. Descendez et continuez à droite.
Sautez sur les plates-formes et entrez dans le canal de droite. Sautez sur d'autres plates-formes suspendues, détruisez deux bloc et avancez en bas à droite. Frappez le bloc quinze fois dans l'ordre grâce aux deux personnages, récupérez quatre pièces d'attaque puis entrez par le canal vert à droite.
Descendez, avancez à droite et entrez dans le canal rouge. Sauvegardez votre progression, frappez le bloc vingt fois en effectuant des vas-et-viens et obtenez quatre autres pièces d'attaque. Par la suite, poursuivez à droite et entrez dans le canal rouge. Sautez sur les plates-formes, frappez les deux blocs et revenez à gauche pour entrer dans le canal vert.
Frappez l'Emoglobing, répondez aux trois questions du quizz et gagnez 100 pièces. Par la suite, sautez sur les plates-formes et entrez dans le canal rouge en haut à droite. Avancez encore à droite et entrez par le canal rouge. Sauvegardez de nouveau et entrez dans le canal vert à droite.
Descendez, martelez le bouton en bas et effectuez des sauts en vrille pour traverser les ravins à gauche. Frappez la dernière pièce d'attaque, apprenez la nouvelle attaque et entrez dans le canal de gauche.
A présent, sautez sur les plates-formes et frappez les deux blocs. Ensuite, sautez sur la couche de graisse qui se trouve à gauche des plates-formes et révélez-en une. Ensuite, sautez sur les plates-formes de droite et effectuez un saut en vrille pour atteindre la nouvelle plateforme. Effectuez un autre saut en vrille pour atteindre celle d'en haut à gauche et entrez dans le canal rouge.
Rétrécissez Mario et entrez dans le petit chemin à droite. Sautez sur les plates-formes, révélez une plateforme de cubes et montez dessus pour frapper le bouton à droite. Ensuite, revenez sur vos pas, sautez sur la couche de graisse, à gauche du canal rouge, et atteignez la plateforme en haut à droite. Répondez au quiz de l'Emoglobing et prenez le canal rouge.
Sautez sur les plates-formes à droite, frappez les deux blocs et atteignez celle en haut à droite. Effectuez un saut en vrille vers la droite pour atteindre les canaux et entrez dans le tube vert.
Frappez les deux blocs, sauvegardez la partie et avancez à droite. Après la scène, sautez sur les plates-formes et effectuez un saut en vrille pour libérer la princesse. Après une autre scène, préparez-vous à affronter un autre boss.
Boss : Alpha
Repérez les couleurs du boss, utilisez Mario pour attaquer les orbes rouges et Luigi pour attaquer les orbes verts. Lorsqu'il attaque, repérez l'ordre des orbes qui s'allument et utilisez le personnage approprié pour les contrer avec le marteau. Lorsque tous les orbes virent au bleu, le boss se divise en six clones et entourent les deux héros. Ces premiers lancent des faisceaux électriques. Sautez au bon moment pour les esquiver. Ensuite, repérez le vrai boss qui s'illumine avant de se confondre avec les autres et attaquez-le. Répétez ces attaques jusqu'à ce qu'il soit battu.
Après le combat, avancez à droite et entrez dans la zone suivante. Après une autre scène, sautez sur les plates-formes et atteignez la pièce suivante. Après une troisième scène, vous reprenez le contrôle de Bowser.