Foncez droit devant en direction de la Tour Wayne pour déclencher la cinématique. Votre première mission sera de rejoindre le haut de la tour. Prenez le contrôle de Cyborg pour faire tomber le conteneur bleu. Ouvrez-le en détruisant le cadenas doré. Utilisez ensuite le pouvoir de Green Lantern pour créer un pont avec les pièces vertes éparpillées.
Dans la salle suivante, tirez la poignée orange avec Cyborg et utilisez à nouveau le pouvoir de transformation de Green Lantern. Utilisez la combinaison Antigel de Robin pour geler la paroi. Dans la salle suivante, utilisez la lance réfrigérante le long des tuyaux pour permettre à Cyborg de progresser. Cassez les briques Lego dorées afin que Green Lantern puisse fabriquer un robot.
Grace au chemin fabriqué par le robot, Batman pourra récupérer sa super combinaison. Montez sur les décombres et détruisez la porte blindée à l'aide d'une bombe. Dans l'ascenseur, utilisez la lance réfrigérante de Robin pour éteindre les flammes et activer le mécanisme gelé sur la paroi. Tirez la poignée à l'aide du grappin de Batman pour rejoindre l'étage supérieur.
Libérez la combinaison anti-choc de Batman en activant le mécanique gelé avec Robin. Continuez à progresser vers les hauteurs. Avec Batman, faites surchauffer les lignes électriques pour libérer des pièces vertes que Green Lantern pourra utiliser pour détruire l'hélice.
Une fois tout en haut de la tour, détruisez le décor et fabriquez un projectile avec le pouvoir de Green Lantern. Utilisez Cyborg pour ouvrir le sas qui renferme la combinaison anti-radiations de Robin. Nettoyez tous les déchets toxiques puis prenez contrôle de Cyborg pour actionner la poignée.
Empruntez le nouveau passage et électrocutez une dernière fois le Robot Joker en activant le terminal avec Batman. La confrontation avec le Robot sera alors inévitable. Détruisez les éléments du décor pour construire un canon. Alternez entre les tirs au canon et l'élimination des vagues de sbires jusqu'à ce que ce Green Lantern puisse achever une nouvelle construction.
Suivez le robot Joker dans sa chute. Evitez les missiles et les objets du décor. Sur le robot, éliminez les sbires et visez le Joker 4 fois avec le Batarang (attendez qu'il soit à découvert).