Revenez dans la chambre de Patrick et si vous avez bien l'échantillon d'eau, James va aller dans le laboratoire pour fabriquer de la nitroglycérine. Revenez ensuite vers la cathédrale puis vers la porte qui était bloquée. La nitroglycérine devrait avoir son petit effet et vous pouvez enfin entrer. A l'intérieur, vous allez tomber nez à nez avec une plante monstrueuse et gigantesque, vous pouvez aller à gauche ou vers le haut. Allez d'abord à gauche pour examiner le cercueil et repartez pour prendre le chemin vers le haut. De là, vous allez pouvoir partir à l'arrière pour admirer la hauteur de la plante puis montez les escaliers. Vous allez arriver devant une machine bizarre avec huit rangées de quatre boutons. Pour trouver la solution de cette énigme, jetez un oeil à la Lettre Ancienne. Pour les plus fainéants d'entre-vous, choisissez la séquence : Secret / Douleur / Hommes / Lumière.
En poursuivant votre exploration, vous trouvez le cadavre de Patrick. Après la cinématique, allez parler à Edward qui va alors mettre le bras de Daniel dans l'eau. Ceci a pour effet d'embraser tout et vous n'avez plus d'autre choix que de fuir à toutes jambes. Il va vous falloir maintenant monter au quatrième étage de la Tour tout en combattant les racines enflammées de la plante géante qui vous en veut on dirait. Arrivé tout en haut, vous rencontrez un énorme bourgeon. Allez à droite et vous allez faire la connaissance d'Elaine, ou plutôt de ce qu'il en reste. Vous devez maintenant monter au septième étage de la Tour tout en fuyant Elaine. Si vous y arrivez, vous verrez Elaine se retransformer dans sa forme finale. Le dernier duel peut commencer et vous allez véritablement avoir du mal à la vaincre. Utilisez vos meilleurs sorts et surtout, envoyer Edward au corps à corps pour protéger Koudelka et James des attaques d'Elaine.