Pour détruire le défenseur du noyau avant qu'il ne soit activé, désactivez les deux obélisques qui protègent le dispositif traqueur du centre d'optimisation du GDI (à gauche du cerveau de Cabaal). Pour cela, aidez-vous des deux canons à impulsions électro(magnétiques mobiles. Prenez ensuite le centre d'optimisation et le générateur furtif. Attendez maintenant que le traqueur soit pret et sauvegardez. Lachez le traqueur en espérant qu'il prenne le noyau pour cible.