La bêta de Metal Gear Survive dispose de trois types de missions : les faciles, les normales et les hebdomadaires. Sur l'écran de mission, vous pouvez inspecter les différentes récompenses que vous pouvez obtenir en fonction de la note obtenue à la fin de votre partie. Ces récompenses sont aléatoires mais vous gagnerez toujours de l'énergie Kuban (utile pour monter de niveau) en fin de partie.
Sur la gauche, vous pouvez consulter le niveau conseillé pour cette mission ainsi que votre meilleur score si vous l'avez déjà tentée. Le niveau de la mission correspond au niveau le plus bas des ennemis que vous rencontrerez. Il est donc tout à fait possible de croiser des ennemis de niveau 20 dans une mission de niveau 10. L'inverse n'est cependant pas possible puisque les ennemis seront forcément du niveau de la mission au minimum.
L'option "Match rapide" vous permet de rechercher d'autres joueurs pour effectuer une mission aléatoire (du niveau sélectionné) à plusieurs.