Pokémon Ultra-Soleil et Ultra-Lune sont deux déclinaisons différentes du même jeu, avec des particularités propre à chaque version parue sur Nintendo 3DS. Première particularité de Pokémon Ultra-Lune et l'une des plus importantes : elle se trouve évidemment au niveau des listes de Pokémon qu'il est possible d'obtenir (par fossile notamment) ou de capturer que dans cette version Ultra-Lune :

Pokémon exclusifs de Pokémon Ultra-Lune

• == Pokémon communs exclusifs de Pokémon Ultra-Lune ==
• == Pokémon légendaires exclusifs de Pokémon Ultra-Lune ==

Ultra-Chimère et membres de l'Ultra-Commando dans Pokémon Ultra-Lune

Dans Pokémon Ultra-Lune, le dresseur affronte deux membres différents de l'Ultra-Commando : Cym et Solie. Deux autres antagonistes vous attendent dans Ultra-Soleil.

La quête principale d'Ultra-Lune vous fera également vous frotter à l'Ultra-Chimère inédite UC-Empilage, absente de l'autre version du jeu.

Cycle jour / nuit différent selon la version

Comme dans Pokémon Soleil / Lune, le cycle jour / nuit est différent selon les versions :

• Dans Ultra-Lune, le temps est décalé de douze heures, et les cycles d'autant : à midi dans le monde réel, il est minuit dans Ultra-Lune ; les iles d'Alola seront donc plongées dans la nuit de 8h du matin à 18h le soir.