L'aventure débute sur un écran noir et un dialogue entre le héros et le fameux professeur dont la réputation n'est plus à faire : le Professeur Samuel Chen. Ce dernier vient réveiller le héros en plein sommeil nocturne et ce petit speech permettra tout simplement de régler l'heure et la date de votre partie.

Une fois le réglage terminé le Prof. Chen se présentera et fera son légendaire discours introduisant le monde des Pokémon et l'harmonie Homme/Pokémon qui y règne. Bien sûr il "reste encore beaucoup à découvrir" et c'est là que vous aurez votre rôle à jouer.

Mais avant de prendre possession du héros le joueur devra répondre à une dernière question essentielle :

Et voilà, ça commence. Le joueur se retrouve dans la chambre du héros et prend pleinement contrôle de son personnage.