Pour venir à bout des boss de Mega Man 4 plus facilement et ainsi obtenir les bonus et power-up plus rapidement, il est conseillé de les affronter dans l'un des ordres suivants :

• Pharaoh Man → Ring Man → Dust Man → Skull Man → Dive Man → Drill Man → Toad Man → Bright Man

OU

• Toad Man → Bright Man → Pharaoh Man → Ring Man → Dust Man → Skull Man → Dive Man → Drill Man

OU

• Ring Man → Dust Man → Skull Man → Dive Man → Drill Man → Toad Man → Bright Man → Pharaoh Man