Récits parisiens
Cinquante missions aux objectifs variés vous permettant entre autres de gagner de l'argent (parfois de grosses sommes).
Le café-théatre
Introduit au cours de la campagne principale, le café-théatre est le QG d'Arno que vous pouvez rénovez pour gagner plus d'argent (le coffre se remplit un peu toutes les 10 minutes) et débloquer 5 missions annexes.
Les clubs de réunion
Sept cafés sont à rénover dans les quartiers de Paris, ils vous ouvrent l'accès à une mission par sous-quartier vous permettant de les "libérer" (des alliés s'y trouveront et pourront vous aider en cas de conflit). Les rénovations et les missions associés augmentent vos revenus du café-théatre.
Énigmes de Nostradamus
Ces missions requièrent que vous trouviez des symboles disséminés dans tout Paris en utilisant la vision d'aigle dans les zones indiquées sur la carte. Compléter la mission finale permet d'obtenir l'armure de Thomas de Carneillon (l'assassin médiéval du tout début).
Failles Hélix
Dans ces anomalies déjà rencontrées dans le jeu, vous devez récupérer un maximum de points avant de vous échapper pour sauver d'autres assassins piégés. Ces missions vous permettent de gagner de l'argent et des dossiers mais également de trouver les artefacts nécessaires pour débloquer le costume d'Altaïr (il vous faut cependant passer par la companion app avant).
Missions coop
Comme leur nom l'indique, ces 11 missions sont jouables à 2 ou 4 joueurs (bien qu'elles soient également faisables en solo si vous avez un bon équipement). Elles permettent de récupérer les derniers points sync nécessaires pour débloquer toutes les compétences (ils sont cachés dans les niveaux et apparaissent si vous utilisez la vision d'aigle). Ces missions sont rejouables pour acquérir des équipements supplémentaires.
Vols coop
Sept missions vols sont disponibles dans le jeu, l'objectif est cette fois ce s'introduire dans un lieu et d'ouvrir un coffre sans déclencher de conflit. Plus vous vous faites remarquer et plus la récompense de fin est réduite.
Club de compétition
Ce mode de jeu est le seul moyen de débloquer certains des équipements légendaires, il s'agit simplement de former un clan avec ses amis et de jouer en mode coop pour accumuler plus de points que les autres clubs.
Objets à collecter
- Coffres : les blancs normaux, les rouges à crocheter, les bleus liés à la companion app et les jaune liés à Initiate, contiennent tous de l'argent ou des équipements
- Cocardes : situés en général en hauteur, celles-ci débloquent de nouvelles couleurs pour la tenue d'Arno
- Artefacts : disposés sur les murs des bâtiments (souvent en intérieur), trouver tous les artefacts d'un quartier débloque un équipement
Évènements aléatoires
Principalement des hommes à plaquer ou à tuer, ces évènements apparaissent très souvent dans les rues de Paris. En faire 10 puis 20 débloquent des équipements puis de bonnes sommes d'argent à chaque palier supplémentaire atteint