Une fois que Jango s’est enfuie, retournez simplement à votre vaisseau et lancez-vous à sa poursuite dans l'espace. Ce dernier ne tarde pas à comprendre que vous le suivez, mais c’est déjà trop tard vous avez quasiment retrouvé sa trace. Cette fois, c‘est un combat spatial qui se déclenche.
Le combat commence par une première phase où Boba Fett va tenter de vous distancer dans le champ d'astéroïde. Vous allez alors devoir éviter les astéroïdes et les mines lancées tout en faisant tomber la barre de bouclier, puis de vie du vaisseau de Boba Fett.
Une fois que ces deux barres sont réduites à zéro, Bobba disparaît de nouveau et après un petit instant vous le retrouvez. Vous vous lancez alors à sa poursuite dans le milieu d'un astéroïde. Faites attention, l’espace est assez restreint et il est facile de se faire toucher par les mines. Toutefois, il est aussi assez simple de toucher le vaisseau.
Enfin, une troisième phase va se déclencher et si elle semble assez classique dans un premier temps, quand vous ferez descendre le vaisseau autour des 25% de vie, Boba Fett va commencer à vous prendre en chasse. Une cinématique se lance alors et vous évitez une torpille de ce dernier de justesse. Vous pouvez alors le suivre à bonne distance jusqu'à Géonosis où vous découvrez que Dooku fomente un plan contre la République.
Vous avez alors une nouvelle cinématique et vous basculez cette fois sur Anakin qui protège toujours Padmé, mais qui a une vision de sa mère qu’il voit mourir. Padmé décide alors de se rendre avec lui sur Tatooine pour voir si tout va bien. Dirigez vous vers le vaisseau et prenez la direction de Mos Espa.
Un fois sur Mos Espa, rendez vous dans la ville et plus particulièrement dans l'échoppe de Watto pour en savoir plus sur votre mère. Celui-ci vous dévoile alors l'avoir vendu il y a quelque temps à un fermier hydroponique. Retournez alors à l'entrée de la ville, au niveau du taxi speeder.
Choisissez alors de vous rendre au désert de Jundland et devant la ferme hydroponique vous allez retrouver une vieille connaissance, C3PO. Vous rencontrez aussi Lars, le mari de la mère de Anakin qui lui raconte qu’il y a quelques jours des pillards Tusken ont enlevé sa femme. Lancez vous à l'assaut du village. Vous arrivez alors rapidement au village et vous vous rendez compte que la mère d’Anakine est morte.
De retour au vaisseau, une nouvelle cinématique s'enclenche, c’est Obi Wan qui fait part de ses découvertes. Le conseil demande à Anakin de ne pas intervenir, mais Padmé décide d'y aller quand même. Prenez alors la direction de Géonosis. Une fois sur place, continuez sur le chemin et éliminez les quelques groupes d’ennemis.
Vous arrivez dans ce qui semble être une porte vers un souterrain, mais elle est verrouillée. Pas de problème, utilisez simplement la force pour ouvrir les deux crochets dans un premier temps et utilisez la de nouveau pour ouvrir cette fois la porte et pouvoir pénétrer dans l’usine.
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