Une nouvelle fois, votre aventure commence par un combat contre un groupe de Nescients. Après la scène cinématique, vous trouvez deux coffres (un Ether et une Lettre-ballon), accompagnés d'un Mog et d'un point de sauvegarde. Empruntez ensuite la porte de droite dans le couloir. Prenez à droite dans ce nouveau couloir, continuez tout droit jusqu'à la prochaine sortie tout en éliminant les ennemis. Dans cette pièce circulaire, récupérez une Potion+ dans le coffre et entrez dans le téléporteur, au centre. Récupérez la Carte dans le coffre derrière vous et profitez du point de sauvegarde avant de passer la porte de gauche. Vous retrouvez Stitch qui se joint à vous pour affronter un groupe de Nescients. Lorsque votre allié rebondit sur le sol, approchez-vous de lui et appuyez sur les touches Carré puis Croix pour vous servir de lui comme projectile et infliger des dégâts aux ennemis. Vous obtenez un Bonus HP. Ouvrez ensuite les diverses cellules en utilisant les élévateurs pour récupérer quatre coffres : un Cristal abondant et une commande d'attaque Coup éclair dans les cellules de gauche, un sticker Tac, une commande d'action Coup en traitre et une Mégapotion à droite. Pour atteindre certaines cellules, utilisez des attaques qui permettent de glisser dans les airs rapidement. Si vous avez des difficultés, sachez que vous obtiendrez la capacité Glissade un peu plus loin dans ce monde. Rebroussez ensuite chemin jusqu'au téléporteur et dirigez-vous vers la zone encore inconnue. Aqua s'équipe de son armure pour sortir dans l'espace. Vous allez pouvoir affronter des Nescients à l'aide de votre Keyblade transformée en vaisseau. Vous pouvez vous servir des tours sur les côtés pour éliminer vos ennemis. Lorsque vous aurez fait le ménage, vous obtiendrez la commande d'action Glissade aérienne. Après la scène, retournez dans le couloir et prenez à gauche cette fois. Sautez en bas, éliminez les Nescients et ouvrez le coffre pour obtenir une commande d'attaque Déferlement Brasier. Activez maintenant la machine, ce qui aura pour effet de désactiver la gravité pour atteindre les plates-formes en hauteur. Activez la prochaine machine pour récupérer une commande de tir visé Pluie multicolore dans le coffre du même niveau et réenclenchez la gravité zéro. Un sticker OVNI vous attend au centre de la zone au même niveau, sautez dans sa direction puis glissez pour l'attraper. Continuez votre ascension jusqu'à la sortie. Stitch vous prête à nouveau main-forte en attaquant le Capitaine avec son pistolet-laser. Dès le début, collez-vous à votre adversaire pour éviter ses tirs de laser (que vous pouvez éventuellement parer pour les lui renvoyer) et profitez-en pour enchainer quelques combos. Il peut vous attaquer avec ses poings ou foncer vers vous si vous êtes éloigné. Lorsque Stitch rebondit sur le sol, approchez-vous de lui et appuyez sur Carré puis sur Croix pour l'utiliser comme projectile et l'envoyer vers Gantu. Pendant que ce dernier est occupé avec l'extra-terrestre, attaquez le plus possible. La présidente du Grand Conseil intervient et Stitch est ramené en lieu sûr. Vous obtenez la Chasse aux commandes de l'Espace profond, le Lien-D de 626, une Case supplémentaire et la Keyblade Vol en hyperespace. Retournez dans l'Espace Profond pour ouvrir les quatre derniers coffres, dans la salle où vous aviez combattu Gantu. Récupérez-y le contenu des deux coffres au sol (un Mégaéther et un Cristal affamé) puis grimpez sur les caisses violettes au nord-est pour découvrir une nouvelle zone où se trouvent une Recette Méga attaque et un point de sauvegarde. Retournez dans le hangar et activez la machine anti-gravité. Sautez sur les caisses roses pour atteindre le coffre (une magie Gravité nulle+) sur la plateforme la plus haute. Utilisez le point de sauvegarde récemment découvert pour quitter ce monde.