Lors de vos balades dans les palais et Mémento de Persona 5 Royal, vous croiserez des Ombres qui patrouillent. Afin d’obtenir un avantage non négligeable en combat, il est possible d’attaquer les Ombres par surprise en s’approchant par derrière et en appuyant sur la touche croix quand l’option "embusquer" apparait. Vous jouerez ainsi en premier pendant le combat.
Plusieurs confidents peuvent vous permettre de faciliter les embuscades : Kasumi Yoshizawa peut vous permettre d'éviter d'être pris en embuscade grâce à sa technique Acrobaties. De même, Crochet à chaînes permet de tendre des embuscades à distance grâce au grappin.
Si vous parvenez à tendre une embuscade, le confident Shinya Oda (le petit garçon à la salle d'arcade d'Akihabara) peut parfois vous permettre de commencer le combat en infligeant de lours dégâts grâce à Pluie de balles et Balle électrique.
Par ailleurs, il est possible que vous vous fassiez repérer par une Ombre. Vous verrez alors le niveau d’alerte monter. Pour éviter de rater votre infiltration, vous devez éviter de monter à 100%. Pour cela, si vous avez quelques points en niveau d’alerte, faites le redescendre en tuant des Ombres suite à une attaque surprise. Vous pouvez également fabriquer un outil d’infiltration dans votre chambre qui fera redescendre le niveau d’alerte. De même, le confident Ichiko Ohya (la journaliste), offre de nombreux bonus permettant de gérer le niveau d'alerte plus facilement comme commencer l'infiltration avec un niveau de sécurité largement réduit ou bien qui diminue à chaque découverte d'un nouvel abri.
Pour éviter une mort presque certaine lorsque vous êtes pris en embuscade par de puisssants ennemis, le confident Hifumi Togo peut vous permettre de fuit même si vous êtes encerclé grâce à Kakoi Kuzuchi. Sa technique Touryou est encore plus puissante puisqu'elle vous permet de fuir directement. La capacité Volte-face de Futaba Sakura peut également vous sauvez d'une situation dangeureuse puisque de manière aléatoire, elle peut vous faire commencer le combat par un braquage alors que vous étiez pris en embuscade.
