À la manière des précédents opus, Anno 1800 ne laisse pas le joueur « seul » sur son île. Tout d'abord, nous l'avons vu, celle-ci ne permet pas de subvenir aux besoins de toutes les classes sociales. Plus important encore, cette île de départ devrait rapidement trop petites pour vos ambitions d'urbaniste fou. L'unique moyen d'assouvir votre quête d'espace est donc de prendre la mer et c'est aussi un excellent moyen de nouer quelques lucratifs accords commerciaux tout en assurant la protection de votre domaine.
Pour ce faire, douze navies ont été imaginés par les développeurs et nous les avons répartis en trois grandes catégories. Dans un premier temps, il faut se limiter aux seuls voiliers. Plus tard dans la partie, l'industrialisation permet de débloquer le moteur à vapeur et, avec lui, les premiers « steam ships » comme disent les Anglais. Enfin, la troisième catégorie, davantage fourre-tout, est constituée de l'indispensable vaisseau amiral et de modèles spéciaux que l'on débloque via certaines réussites.
