Deux nouveaux modes de jeu font leur apparition sur la version PC de Zeno Clash 2. Il s'agit de deux modes pour mettre au défi les joueurs. Le premier se nomme Framerate Challenge et nous place face à un flot continu d'ennemis. Le but est de les éliminer le plus rapidement possible avant que le framerate (soit le taux de rafraîchissement de l'image) ne chute en dessous de 25. En d'autres termes, la durée de la partie dépend beaucoup de la puissance du PC.
Le second nouveau mode, Colosseum Challenge, est plus classique. Il s'agit ici de détruire des vagues d'ennemis en sachant qu'il est possible d'améliorer son équipement entre chaque vague, et qu'il est également permis de jouer avec autant d'autres joueurs que voulus.
En plus de ces deux modes inédits, et a priori réservés à la version PC, Zeno Clash 2 permet désormais aux joueurs d'obtenir trois cartes Steam à collectionner.