L'année dernière, certaines fuites laissaient entendre que Marvel Ultimate Alliance 2 couvrirait la période Guerre Civile des comics. Cette information est désormais confirmée grâce aux images ci-dessous. Dans cet énorme cross-over, les personnages doivent choisir leur camp suite à la décision du gouvernement d'instaurer une loi visant à répertorier les super-héros, et donc à divulguer leurs identités secrètes. Deux clans s'opposent alors : les favorables à la loi (menés par Iron Man) et les défavorables (menés par Captain America). De lourdes et graves conséquences découleront de cette Guerre Civile que nous vous conseillons déjà vivement de découvrir en lecture. Le jeu doit quant à lui sortir dans le courant de l'année sur à-peu-près tous les supports.