Nobilis ouvre une petite galerie des personnages principaux qui graviteront autour du génie Léonard dans cette aventure point and click. François 1er, bien sûr, l'ami de toujours autant que le mécène principal de l'artiste. Babou de la Bourdaisière, maîtresse de François 1er, aidera grandement le joueur grâce à ses connaissances importantes sur le Château du Clos Lucé, demeure du roi et de Leonard, ainsi que grâce à sa capacité à courtiser nombre d'hommes. Enfin, le héros et personnage jouable, Valdo, ancien apprenti de Francesco Melzi, lui-même élève de De Vinci. Il lui sera sommé par un inconnu de retrouver un manuscrit essentiel rédigé par le grand artiste.

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