Phantasy Star - Generation : 2 est le remake du classique jeu de rôle Phantasy Star II. Vous êtes un jeune habitant de la ville futuriste de Paleo, capitale d'une planète nommée Mota se situant dans le système solaire Algo et vous êtes envoyé pour enquêter sur le silence radio que maintient une équipe de scientifiques depuis un projet sur des modifications génétiques. Votre mission de reconnaissance va bientôt se transformer en aventure périlleuse.