Mega Man est la réédition sur la console virtuelle 3DS de la toute première aventure du petit robot. Parti à la poursuite de six de ses congénères reprogrammés pour faire le mal. Elu par les habitants de la Terre comme sauveur, Mega Man va devoir pénétrer les différents univers de Monsteropolis et se servir des fonctions de son armure pour affronter les humanoïdes du Dr Wily. A chaque monstre vaincu, le héros récupère le pouvoir de son ennemi.