Alors, je crois que tu as mal compris.
"Ne pas être vu", c'est plutôt dans le sens "ne pas être vu en même temps que toi-même, genre, dans la même pièce".
Et dans le cas particulier de Harry et Hermione qui cherchent à sauver Buck et Sirius, c'est aussi dans le sens : "ne pas se faire chopper". T'imagine le b*rdel que ça serait si ça arrivait ? On comprendrait qu'ils ont utilisé illégalement un Retourneur pour aider une créature et un criminel condamnés à mort à s'enfuir !
Du coup, Hermione a suivi ses cours normalement, elle est bien entré dans les salles de classes, elle s'est installée normalement et voilà. Le livre le dis d'ailleurs. A un moment, Ron ne comprend pas car des élèves ont affirmé qu'Hermione était bien avec eux pendant tel cours, sauf qu'au même moment, Hermione avait Divination (ou autre) avec Harry et lui.
J'imagine qu'Hermione et MacGonnagal se sont arrangées pour que les cours qu'elle passe en même temps se situent assez loin l'un de l'autre pour éviter qu'Hermione tombe sur elle-même.
J'imagine aussi qu'Hermione a a chaque fois utilisé le Retourneur à un endroit stratégique.
Ch'ais pas, imaginons : elle a cours de Divination, puis elle se planque dans un placard à balais (ou des toilettes) pas loin du cours d'Arithmancie, elle utilise le Retourneur pour revenir une heure en arrière puis elle ressort du placard (ou des toilettes) et se rend direct en Arithmancie.