J'ai du mal à cerner ta question l'auteur, surtout que t'as l'air de t'y connaitre assez pour te répondre :/
L'un des objectifs du jeu est de compéter le compendium, donc la première fois que tu vois un nouveau masque "trésor" tu devrais sans doute le capturer. Ils sont utiles pour les fusions et les sacrifices, les avoir des le compendium te permet de les invoquer quand ça te chante moyennant des sous. Ce qui est terriblement utile.
Passé ça, ça dépend de tes envies et de la place dans ton équipe. Les capturer t'épargne le frais pour les invoquer à partir du compendium. Les tuer offre une récompense sympathoche. Bref, dans les deux cas t'y gagnes. Le choix est à faire selon tes besoins.