On ne peut pas choisir les marchandises que les bateaux transportent. Ils transportent automatiquement les ressources nécessaires d'ile en ile.
Par exemple, tu as du minerai de fer sur une ile et ta fonderie est sur une autre ile. Les bateaux transporteront automatiquement le minerai de fer vers l'ile sur laquelle se trouve la fonderie, en fonction des besoins de la fonderie.
De même pour les matériaux de construction, si tu construits un bâtiment sur une ile, les bateaux transporteront automatiquement les matériaux de construction, mais aussi le personnel nécessaire (constructeur, niveleur...)
Concernant les soldats, il y a une astuce. Il faut construire un entrepôt dédié au stockage des soldats et interdire le stockage des soldats dans les autres entrepôts (port compris) de la même ile. Une fois les bâtiments militaires pleins de soldats, tu les vides. Les soldats vont dans l'entrepôt dédié. Ensuite tu déconnectes cet entrepôt de ton réseau routier et tu redemande le remplissage de tes bâtiments militaires. Ne pas oublier d'autoriser à nouveau la présence de soldat dans le port. Les bateaux iront chercher les nouveaux soldats et les amèneront à bon port.