L'essence même du jeu est l'infiltration : guetter le meilleur moment pour égorger un ennemi, distraire un soldat avec l'espion, effectuer un tir à longue distance sur un garde posté près d'une patrouille adverse. Toutefois, même s'il se veut furtif avant tout, le jeu permet d'assouvir quelques pulsions meurtrières. Les Commandos disposent tous d'un pistolet, qu'ils peuvent dégainer lorsque la situation devient critique. Mais il ne faut pas se leurrer : en cas d'alarme, les ennemis deviennent surexcités, des patrouilles voire des véhicules supplémentaires parcourent la carte à la recherche d'ennemis. Et dans la plupart des cas, ils tirent à vue. La mort d'un seul Commando met aussitôt fin à la mission. Notez que certains objectifs de missions nécessitent la destruction de véhicules ou de bâtiments. Auquel cas une alarme est aussi déclenchée. Il vaut mieux donc toujours préparer un plan d'attaque mais aussi l'évacuation de ses hommes avant de passer à l'action.
Quelques outils sont disponibles pour effectuer au mieux les missions. Le plus utile est le cône de vision des ennemis. Grâce à cela, il est possible de vérifier en temps réel ce que voit un soldat ennemi. L'écran peut aussi être séparé en plusieurs mini-écrans. Ceci est très utile pour infiltrer une zone ou se débarrasser d'un soldat tout en contrôlant les allers-retours d'une patrouille par exemple. Bien sûr, une carte de mission est consultable à n'importe quel moment, elle renseigne sur la position des ennemis, ainsi que les objectifs. Enfin, une option permet de suivre à la trace un ennemi ou l'un de vos Commandos.