Fire Emblem Fates a la particuliarité d'être décliné en trois versions, chacune possédant sa propre trame scénaristique indispensable à la compréhension globale de l'histoire. Les versions Héritage et Conquête paraîtront en même temps, et l'achat de l'une offre une réduction sur la seconde en téléchargement sur l'eShop. La troisième version, Revelation, paraîtra en dématérialisé quelques temps après les deux premières.

Le Collector inclut toutes les versions du jeu ainsi qu'un artbook et une pochette pour ranger la 3DS, le tout pour 79.99 dollars. Si nous ne connaissons toujours pas la date de sortie européenne, l'attente ne devrait plus être bien longue puisque les deux premiers jeux paraîtront le 19 février 2016 sur le sol américain.